截至2017年，黟县共有卫生机构13个，其中，医院2所，卫生院8所，与上年持平。卫生机构床位数233床，其中医院、卫生院床位223床，与上年持平。卫生机构人员数418人，比上年增加8人，其中，卫生技术人员322人，增加5人；医生194人，减少5人；执业（助理）医师133人，增加3人；注册护士183人，减少2人；卫生防疫人员22人，与上年持平。全年婴儿死亡率为0.47%，比上年提高0.21%。5岁以下儿童死亡率0.59%，比上年提高0.2%。推进家庭医疗签约服务，全县有偿签约11721人，其中：贫困人口签约3935人，签约率100%。巩固和完善新农合制度，全县新农合参保人数72978人，参合率达100.1%。平稳实施全面二孩政策，计生统计年度出生882人，同比增加102人，其中二孩出生382人，同比增加134人。全县出生人口总政策符合率为97.5%。